Image J

2021-04-10zhang阅读(2947)评论(0)

欢迎分享本文到朋友圈，文章转载、投稿、业务合作联系请微信Havana90~~ 我们知道，8  bit灰度图中每一个像素点都可以使用0~255（从最黑到最白）的色阶值来表示。图像二值化（ Image Binarization），简单...

2020-12-11zhang阅读(2178)评论(0)

欢迎分享本文到朋友圈，文章转载、投稿、业务合作联系请微信Havana90~~ 这是来自于粉丝的提问，最近一直忙得很，拖了很久一直没有回复。今天咬牙抽时间，居然在两个小时回答了她的问题还顺路整理成了教程，-_-||。 本教程适合于图片文件名具...

2020-11-04zhang阅读(2690)评论(0)

欢迎分享本文到朋友圈，文章转载、投稿、业务合作联系请微信Havana90~~ 一提到CLUT（Color Look-up table，颜色查找表），必然要知道的另一个概念是伪彩（Pseudo-color）。 伪彩色（Pseudo-color...

2019-12-06zhang阅读(5453)评论(0)

欢迎分享本文到朋友圈，文章转载、投稿、业务合作联系请微信Havana90~~ 3777字+图文，两个晚上~ 其实上次计算荧光Ratio的方法，就可以用来定性描述荧光共定位。毕竟同一个位置，不同分子所带的两种荧光都比较强的时候，它们之间就有可...

2019-11-29zhang阅读(5291)评论(0)

在丁香园看到一个比较老的帖子： 然后有人不知道怎么做这样的图： 这个问题其实蛮简单的，正好顺手撸一篇教程。  1、打开一张荧光图片，并拆分成三个通道图，具体见《利用Image J拆分和Merge荧光图片》。 对于位图应该有这样的认识：每一个...

2019-11-28zhang阅读(5894)评论(0)

测量荧光图片的荧光强度，也是一个常用的操作，单荧光图片直接测，多荧光通道merge图片拆分一下通道也很方便。下面就荧光强度测量中常常会遇到的三种情况进行图示：通道整体平均（加和）荧光强度、指定区域平均（加和）荧光强度以及大量细胞单独的平均（...

2019-11-16zhang阅读(3917)评论(0)

细胞划痕实验作为检测细胞迁移能力的金标实验，应用非常广泛。其原理是在融合的单层细胞上人为制造一个空白区域，称为“划痕/伤口”，边缘的细胞接收到迁移信号会逐渐进入空白区域使“划痕/伤口”愈合。因其类似体外伤口愈合过程，又名伤口愈合实验（Wou...

2019-11-13zhang阅读(5244)评论(0)

上次有同学问如何添加标尺，这次正好到这个内容了~~   01 设置像素与实际长度的比例关系 很多时候，我们获得的图片尤其是非原始图片或者没有写入像素与实际长度关系，这个时候如果要对图片中的形状进行实际测量，比如实际长度、面积之类的测量，就需...

2019-11-08zhang阅读(3399)评论(0)

大家都知道，Image J最大的优点就是它是开源的，并且有大量的插件和脚本可以使用。其中BAR（A collection of Broadly Applicable Routines）程序集包含了用于数据分析、图像注释和图像分割的宏、脚本和...

2019-11-06zhang阅读(2622)评论(0)

01  角度测量 角度测量有专门的角度测量工具Angel Tool，不过利用直线工具也可以进行简单的角度测量。 1、选择File-Open Samples-Leaf，打开软件自带例图； 2、利用Angel Tool（角度工具）画出...