图像量化

Image J计算荧光Ratio并加伪彩~-如图所示|张老湿科研绘图
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Image J计算荧光Ratio并加伪彩~

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在丁香园看到一个比较老的帖子: 然后有人不知道怎么做这样的图: 这个问题其实蛮简单的,正好顺手撸一篇教程。  1、打开一张荧光图片,并拆分成三个通道图,具体见《利用Image J拆分和Merge荧光图片》。 对于位图应该有这样的认识:每一个...

Image J玩转荧光强度测量-如图所示|张老湿科研绘图
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Image J玩转荧光强度测量

zhang阅读(5894)评论(0)

测量荧光图片的荧光强度,也是一个常用的操作,单荧光图片直接测,多荧光通道merge图片拆分一下通道也很方便。下面就荧光强度测量中常常会遇到的三种情况进行图示:通道整体平均(加和)荧光强度、指定区域平均(加和)荧光强度以及大量细胞单独的平均(...

手把手教你用Image J测量细胞划痕面积-如图所示|张老湿科研绘图
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手把手教你用Image J测量细胞划痕面积

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细胞划痕实验作为检测细胞迁移能力的金标实验,应用非常广泛。其原理是在融合的单层细胞上人为制造一个空白区域,称为“划痕/伤口”,边缘的细胞接收到迁移信号会逐渐进入空白区域使“划痕/伤口”愈合。因其类似体外伤口愈合过程,又名伤口愈合实验(Wou...

Image J测量实际尺寸:设置和添加标尺-如图所示|张老湿科研绘图
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Image J测量实际尺寸:设置和添加标尺

zhang阅读(5244)评论(0)

上次有同学问如何添加标尺,这次正好到这个内容了~~   01 设置像素与实际长度的比例关系 很多时候,我们获得的图片尤其是非原始图片或者没有写入像素与实际长度关系,这个时候如果要对图片中的形状进行实际测量,比如实际长度、面积之类的测量,就需...

Image J基础操作:给图片添加文字和标注-如图所示|张老湿科研绘图
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Image J基础操作:给图片添加文字和标注

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对图片添加标注和文字是科研图片处理中一个非常基础的操作,Image J也可以进行这方面的处理。 01 利用描边和填充添加 在绘制好选区(几乎只会用到箭头工具)之后选择:Edit-Draw(描边,快捷键Ctrl+D),使用事先设定好的颜色和粗...

Image J基础操作:选区和选区管理器-如图所示|张老湿科研绘图
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Image J基础操作:选区和选区管理器

zhang阅读(3822)评论(0)

选区是Image J以及其他图像处理软件中的一种基本操作单元,只有建立了选区之后才能针对选区进行一些分析和计算。比如,对图像中的每个物体记录一个选区,则可以通过统计选区数目来计数;也可以分析每个选区内的某些属性,比如依据选区进行划线、填充,...

Image J进行细胞和菌落计数:不能装逼的几个方法-如图所示|张老湿科研绘图
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Image J进行细胞和菌落计数:不能装逼的几个方法

zhang阅读(4636)评论(0)

这是一篇不能用来装逼的教程,因为都是常规方法,网上应该烂大街了~ 那为啥你还要写教程?因为你不一定会啊,别人也未必有张老湿讲得好啊,哈哈哈哈哈哈 01  手动计数 手动计数有两种方式,一种是单类计数,适用于同一类型的细胞或菌落或者...

利用Image J拆分和Merge荧光图片-如图所示|张老湿科研绘图
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利用Image J拆分和Merge荧光图片

zhang阅读(4369)评论(0)

荧光图片的拆分和merge应该是科研图片处理中非常基础的一个操作了,Photoshop和Image J等软件都可以完成。这里演示下Image J如何快速拆分和合并。 01 荧光图片通道拆分 1、随便打开一张Merge之后的RGB荧光图片; ...

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