蛋白酶体的主要作用是通过泛素标记的途径降解细胞不需要的或受到损伤的蛋白质。在真核生物中,蛋白酶体位于细胞核和细胞质中。有时候我们在绘制细胞信号通路的时候,会用到这个细胞器。我们可以用PPT画一个简笔画(图1),也可以多花点心思画得立体一点(图2),都非常简单,下面详细描述一下3D蛋白酶体画法。这个教程画蛋白酶体是其次,重点要掌握具有立体感的球体绘制以及图形单元的前后层次调整。
图1 蛋白酶体简笔画
图2 两种3D蛋白酶体画法
1绘制蛋白酶体的基本单元
1.1 首先绘制一个球体,并渐变填充颜色(参数见图3左),使之看起来具有立体感,然后将其复制八次,把八个小球排成一圈,在排列过程中注意对称位置的球要对齐(图3)。图3右下用红色虚线模拟PPT里面的智能参考线,使对称位置的球对齐。
图3 球的画法及排列方式
1.2 通过“右键-置于顶层/置于底层”,调整球的先后顺序,使之符合透视原理(图4左)。如果单元元件比较多的情况下,不知道要把元件往下或往上调整几层,则从“开始-选择-选择窗格”调出选择窗格(快捷键Alt+F10),每个元件都在窗格里面显示。点击要调整的元件,窗格里面会自动底色标示,记住编号,再点击要调整元件的相邻元件,则可知二者的相对关系,直接在选择窗格里面上下拖动元件,调节二者的先后顺序即可(图4中)。调节完成球的先后顺序之后,再微调8个球的位置,使之围城一个圈,最终效果见下图右下角(图4右边)。
图4 调整各个球体的层次顺序
1.3 选中8个球作为一个整体,复制两次,拖动到合适位置;选中其中一组8个球,右键-设置形状格式-填充-渐变填充,改变渐变光圈里面的色标(下图红圈表示)颜色,中间改成一个浅橙色,最右边的色标改成橙色,那么新复制出来的一组球体变成了橙色球体,同样的方法把另一组球体设置成紫棕色球体(注意,整个过程中由于每个球的设置都是一样,所以可以全选一同修改其颜色;如果把8个球组合了,则不能一同修改每个球的颜色)(图5)。获得黄色、橙色、紫棕色的三组球之后,可以把它们分别组合,以后将以8个球围成的小圈作为作图单元。
图5 绘制蛋白酶体三色基本单元
2绘制蛋白酶体的催化核心
两组黄色球放中间、两组橙色球放两段,调节好先后顺序,拼接到合适位置即可完成蛋白酶体中20S催化核心的绘制(图6)。
图6 蛋白酶体催化核心绘制
3绘制蛋白酶体调节单元及组合成蛋白酶体
蛋白酶体两端的调节单元我们提供两种绘制方法,先来看简单的一种。
3.1 调节单元画法一:
a. 把紫棕色的8球单元复制一次,取消组合,复制粘贴两个紫棕色小球插入到8球单元中间,使之成为一个10球小圈(图7上)。然后再把紫棕色的8球单元复制一次,然后把8球单元+10球单元+8球单元拼接到一起,注意先后顺序,即可获得蛋白酶体的一个调节单元,复制获得另一个调节单元(图7下)。
图7 蛋白酶体调节单元绘制方法一
b. 把两个蛋白酶体调节单元适当压扁拉宽,添加到催化核心两段,即可获得一个蛋白酶体(图8)。如果不喜欢紫棕色、橙色和黄色的配色,我们改变一下颜色配置,既可以获得其他颜色的蛋白酶体,我们这里画了一个蓝色系的蛋白酶体。
图8 绘制方法一得到的蛋白酶体
3.2 调节单元画法二:
下面来看另外一种蛋白酶体两端调节单元的画法,这种稍微复杂一点,但是看起来效果会好一点。
a. 用曲线绘制一个锅状轮廓,添加一个椭圆形作为调节单元中间的孔(图9左),椭圆线性渐变填充,参数见图9左。总的而言是两端用深色,中间用浅色,模拟两端的阴影。锅状轮廓里面填充深色,线性渐变填充,之所以用渐变填充是为了使这个调节单元有明暗变化,看起来更像那么回事,至于中间的颜色设置是随便设的,深深浅浅都有,但是深浅与两端的深紫棕色不要相差太远。
最后绘制高光部分,可以用曲线工具画出高光部位的形状然后填充渐变,从边缘往中间加深,由于填充的是白色,所以通过不同位置色标的透明度来完成这种渐变。这里为了省事直接画的椭圆,几个椭圆调整方向组合成一个高光区域。另外一个绘制高光的方法是用曲线画出高光区域,纯色填充,设置柔化边缘,层层堆积画出高光区域,比较麻烦,但是更逼真,这里为了简化步骤,没有使用。
图9 蛋白酶体调节单元绘制方法二
b. 绘制好一个调节单元之后,复制粘贴并旋转180°,作为另一个调节单元,但是在旋转之后另一个调节单元的高光区域已经发生变化,所以要根据实际进行修改,最后把两个调节单元和中间的核心单元拼接在一起就是一个蛋白酶体(图10):
图10 绘制方法二得到的蛋白酶体
本次教程到此结束。
事实上本次教程提供了三种蛋白酶体的绘制方法:最开始的简笔画、后面两种球状堆砌而成的蛋白酶体。重点要知道球体怎么绘制、元件之间的先后顺序怎么调节,这里留一个问题,本文绘制的球体高光部位在正中间,如何使得高光部位在不同位置呢?比如下面的高光不在正中心的球体如何绘制?
原文始发于微信公众号(张老湿科研作图):PPT科研作图⑨——蛋白酶体的绘制