如何把一万多张黑白图片添加RGB伪彩并Merge?Image J来帮忙!

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这是来自于粉丝的提问,最近一直忙得很,拖了很久一直没有回复。今天咬牙抽时间,居然在两个小时回答了她的问题还顺路整理成了教程,-_-||。

本教程适合于图片文件名具有明显规律,可以区分不同通道的灰度图片的批量处理。



批量伪彩


0、把需要处理的一万多张图片放在一个文件夹(这里命名为Input)里,新建一个名为Output(可以是其他名字)的文件夹用来放置添加伪彩之后的图片。


1、打开Image J批量处理里面的宏代码,Process-Batch-Macro

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2、在批量处理对话框的Input和Output里面定位到第0步设定的两个文件夹;

  • 在File names contains里面输入区分不同通道图片的文件后缀,这里是-ch1sk1fk1fl1;

  • 在下面的代码框里面输入两行代码(注意在英文输入法下输入):

    run("Blue");run("RGB Color")

这里的Blue和-ch1sk1fk1fl1对应(事先已知ch1要对应蓝色伪彩),表示所有含有这个后缀的图片都加蓝色伪彩。然后点击Process即可完成蓝色伪彩处理。

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3、同样的方式,把-ch2sk1fk1fl1处理成绿色Green,把-ch3sk1fk1fl1处理成红色Red,修改File names contains和下面第一行代码中的单词即可;

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4、这么三次操作下来,即可完成所有图片的三种伪彩处理;

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批量Merge


1、通过Plugin来运行宏代码“batch RGB merge.ijm”文件;这是别人已经编写好的代码文件,直接拿来用即可。公众号后台回复1211获取下载地址;

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2、在打开的宏代码对话框中,将红、绿、蓝设置对应的文件名后缀,下面的堆栈Open as Stack不要勾选;

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3、找到刚才存放做好伪彩图片的文件夹Output;也可以选择原始文件夹Input,不过这样会慢一点,因为这个插件会再做一次伪彩;

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4、选择(Select)之后会跳出输出文件夹设置对话框,这里继续选择Output,让所有图片都在一个文件夹(也可以选择其他文件夹);

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5、得到所有图片的RGB Merge结果。

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Fiji软件下载



鉴于有些同学说Fiji很难下载,下面我把Fijiwin64版和mac版放在了网盘里面,有需要的请自行下载。

链接:https://pan.baidu.com/s/1JCEtW0jMwnB3mV6jiXlatw

提取码:xol8(请复制粘贴使用提取码,我知道你们分不清1和I和l)



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