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学术图表是科研结果最直观以及最有效的展现方式,直接支撑科研结论,在学术论文、报告、基金申请和结题报告中具有极其重要的作用。学术图表的一个重要特征是具有“自明性”,意思是读者只通过阅读图表就能够迅速读懂图表的意思,而不需要去反复翻阅文稿。因此,为了更好地呈现科研结果,科研工作者需要精心设计与绘制学术图表。
学术图表分为学术图片(图1)和学术表格(图2),学术表格(table)在形式上比较简单,而且几乎所有的学术期刊都要求三线表(three-line table)。
三线表以其形式简洁、功能分明、阅读方便而在科技论文中被推荐使用。三线表的组成要素包括:表序、表题、项目栏、表体、表注(图2)。表序和表题放在表格顶部,表注放在表格底部;这点与图片不一样,图片的图序、标题和图注都在图片底部。表注一般要求使用简洁明了的文字,描述表格的目的、统计方法、标注符号以及所反映的结果,使得表格具有“自明性”的特点。
三线表通常只有3条线,即顶线、底线和栏目线,表格两端及内部一般都没有竖线和斜线。为了美观起见,有些期刊会将顶线和底线设置为粗线,栏目线为细线;也可能三条线一样粗细。但是三线表并不一定只有3条线,必要时可以添加辅助线,比如在项目栏里面添加水平线作为二级分类,在表体里面添加水平线区分子表格,但无论加多少条辅助线,仍称做三线表。
图2 标准三线表(来自图源文献3)
学术图片的种类和获取方式比较复杂,根据其产生来源大概可以分为成像图、数据图和示意图三种类型(图3)。
图3 科研图片分类及处理示意图
1、成像图(Image):使用成像设备采集目标对象的光信号所生成的图片,如相机、成像系统、显微镜、扫描仪等拍摄的照片。这类图片往往需要使用其他软件如Photoshop等进行剪裁、大小和对比度调整等简单操作,才能成为规范的科研用图。要求在采集图像的时候尽可能采集高清(高分辨率)、无损的图片,并且注意记录采集时间、采集条件、采集设备等元数据(原始数据)。一般要求存储成*.tiif格式。
2、数据图(Data Graphic):将科研过程中产生的数据,进行合理的统计分析,最后可视化呈现数据中的规律的图片。主要包括软件绘制的各种点状图、柱状图、箱线图、生存曲线等等,处理的软件有Graphpad Prism、Origin、R语言、Python、Excel等。生成的图片要保存成高分辨率的*.tif格式或者*.eps等矢量格式,以备后续使用,同时注意保存原始数据。
需要注意的是,也可以对成像图的像素进行量化,转变为数据,然后生成数据图,生命科学领域最为常见的如Western Blot电泳图量化后生成的柱状图,常用软件有Image J 、Image Pro Plus和Photoshop等。
3、示意图(Illustration):将科研构思通过绘制的方式形象地展现出来。常见的有流程图、信号通路图、机制图等,常用的软件有Adobe illustrator、C4D、3dmax等,比较讲究绘图技巧。
俗话说“一图胜千言(A picture worth a thousand words (of explanation))”,这句话用在科研领域更是如此。比起学术表格,一张规范、准确、简洁的图片能够更好地向世人呈现作者的研究成果。
甚至在大多数审稿人那里,在评审一篇论文的时候,通常是先看摘要,大致看一看论文的结构,然后重点放在论文的图片上面。如果论文的图片出彩,审稿人的印象也会非常好,对论文的录用与否具有关键作用。
图源文献:
[1]Wiel Clotilde,Le Gal Kristell,Ibrahim Mohamed X et al. BACH1 Stabilization by Antioxidants Stimulates Lung Cancer Metastasis.[J] .Cell, 2019, 178: 330-345.e22.
[2]Kiyozumi Daiji,Noda Taichi,Yamaguchi Ryo et al. NELL2-mediated lumicrine signaling through OVCH2 is required for male fertility.[J] .Science, 2020, 368: 1132-1135.
[3]Botvinik-Nezer Rotem,Holzmeister Felix,Camerer Colin F et al. Variability in the analysis of a single neuroimaging dataset by many teams.[J] .Nature, 2020, 582: 84-88.
以上内容其实原来计划放在我的书本《Graphpad Prism学术图表》里面,加上其他内容有将近两万字。后来由于书本篇幅和内容相关性的限制,还是删掉没放了,这里暂时放在公众号里面,形成一个关于学术图表基本规范的系列吧。
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